中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所系于2016年底，基于上海生命科學研究院人口健康方向所屬的健康科學研究所、營養(yǎng)科學研究所、中科院-馬普學會計算生物學伙伴研究所、中科院-二軍大轉化醫(yī)學研究院、中科院上海生命科學信息中心、中科院上海實驗動物中心等“三所一院兩中心”整合組建而設立。2018年底經(jīng)中科院正式發(fā)文批準，營養(yǎng)與健康所順利進入“率先行動計劃”特色研究所籌建序列。研究所立足上海、輻射長三角、服務全國，針對我國符合中國人群的營養(yǎng)健康標準缺失、慢病防控與健康促進的控制技術方法匱乏、生物醫(yī)學大數(shù)據(jù)資源流失分散等國家重大需求中的科技創(chuàng)新供給力問題，以任務牽引的生物信息技術（BIT）融合發(fā)展、健康保障關口前移為特色學科，以中國人群高發(fā)的腫瘤、代謝性疾病（包括糖尿病及肥胖）和心血管疾病等重大慢病為研究對象，按照慢病防控與健康促進、精準營養(yǎng)與食品安全、生物醫(yī)學大數(shù)據(jù)與健康智庫三大研究方向進行布局。