中科院新疆分院成立于1957年7月30日，作為中國(guó)科學(xué)院在少數(shù)民族自治區(qū)設(shè)立的唯一一所分院，創(chuàng)立之初即定位為新疆經(jīng)濟(jì)、社會(huì)、科技發(fā)展服務(wù)。中科院新疆分院是中國(guó)科學(xué)院在新疆的派出機(jī)構(gòu)，主要職能有：承辦中科院交辦的有關(guān)事務(wù)；協(xié)助中科院進(jìn)行所在地區(qū)研究所領(lǐng)導(dǎo)班子建設(shè)；在授權(quán)范圍內(nèi)代表中國(guó)科學(xué)院與地方開(kāi)展合作；為所在地區(qū)研究所提供服務(wù)。中科院新疆分院系統(tǒng)包括4個(gè)獨(dú)立法人單位，即中科院新疆分院機(jī)關(guān)、新疆生態(tài)與地理研究所、新疆理化技術(shù)研究所、新疆天文臺(tái)。現(xiàn)有國(guó)家級(jí)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室2個(gè)（含培育），中科院重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室4個(gè)，自治區(qū)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室8個(gè)，國(guó)家工程研究中心1個(gè)，國(guó)家工程技術(shù)研究中心1個(gè)，自治區(qū)工程技術(shù)研究中心6個(gè)，國(guó)家級(jí)野外臺(tái)站3個(gè)，中科院級(jí)野外臺(tái)站7個(gè)，國(guó)家級(jí)科普教育基地2個(gè),海外研究基地4個(gè)、野外站12個(gè)。形成了十二個(gè)特色研究領(lǐng)域和方向：綠洲生態(tài)與綠洲農(nóng)業(yè)，荒漠環(huán)境與生態(tài)修復(fù)，干旱區(qū)生物多樣性，中亞成礦域與地質(zhì)成礦，中亞自然資源與生態(tài)環(huán)境；資源化學(xué)、材料物理與化學(xué)、多語(yǔ)種信息技術(shù)、環(huán)境工程與技術(shù)；射電天文與技術(shù)、光學(xué)天文與技術(shù)應(yīng)用、應(yīng)用天文。