寧夏疾病預防控制中心作為省級疾控中心基本職責是：疾病預防與控制、突發公共衛生事件應急處置、疫情報告及健康相關因素信息管理、健康危害因素監測與控制、實驗室檢測檢驗與評價、健康教育與健康促進、技術指導與應用研究。中心于2002年7月由原自治區衛生防疫站、自治區地方病防治所和自治區勞動衛生職業病防治所整合組建。加掛“寧夏回族自治區地方病防治所”、“寧夏回族自治區性病艾滋病防治中心”、“寧夏回族自治區疾病預防控制科學技術研究中心”、“國家食品安全風險監測寧夏中心”牌子，是自治區繼續醫學教育培訓基地、寧夏醫科大學教學實習基地和自治區大學生校外實踐教學基地。中心有6個業務所（疾病預防控制所、慢性非傳染性疾病預防控制所、公共衛生所、職業病防制所、地方病與寄生蟲病防制所、預防醫學檢驗所），科室29個（職能科室8個、業務科室20個）。中心取得WHO和國家認證的實驗室有11個：國家致病菌識別網省級中心實驗室、脊髓灰質炎實驗室、性病中心實驗室、艾滋病確證中心實驗室、麻疹實驗室、碘缺乏病實驗室、省級流感參比中心、乙腦診斷參比實驗室、包蟲病診斷參比實驗室、瘧疾診斷參比實驗室、土食源性寄生蟲病診斷參比實驗室，鼠疫強毒實驗室1個，二級生物安全實驗室9個。本周期推薦認可（CNAS）項目共有36類583項，推薦認證（CMA）項目22類400項。