校區位于大慶市高新技術產業開發區，占地面積114萬平方米，規劃建筑面積32萬平方米，2004年10月建成投入使用后，進一步提升了哈爾濱醫科大學的綜合實力和競爭能力，拓展了學校發展空間。大慶校區現有專兼職教師945人，其中龍江學者2人，哈醫大星聯崗位26人，博士、碩士研究生導師54人。設有基礎醫學院、護理學院、醫學檢驗與技術學院、藥學院、康養產業學院、人文社科系、醫學信息學系、精神衛生學院、體育教研部、公共外語教研部等10個教學院（系、部）。建有1個中心實驗室，9個教學、科研實驗中心，實驗室總數93個。建筑總面積13.45萬平方米，固定資產總值5.34億元，教學儀器設備總值3.69億元。哈爾濱醫科大學的護理學科為國家一級博士、碩士學位授權點和省級重點學科。大慶校區現有25個學科專業開展了博士、碩士研究生教育；普通本科設置16個專業（含方向），涵蓋了醫學、理學、管理學、工學四個學科門類，其中醫學檢驗技術和護理學專業為國家級一流本科專業建設點和省級重點專業，精神醫學、康復治療學、中藥學、藥物制劑、醫學實驗技術等5個專業為省級一流本科專業建設點。截至目前，在校生總數8000余人。學校設有5個臨床教學醫院，為學生臨床專業教學及實習、實訓提供了有力的條件保障和充足的資源平臺。近三年，本科畢業生去向落實率95%以上，標志著大慶校區的辦學理念和人才培養質量得到了社會的高度認可。大慶校區科研工作成果顯著，近年來承擔國家、省、市科研立項課題847項，其中國家自然科學基金資助項目79項，國家社會科學基金資助項目1項，教育部課題15項(教育部人文社會科學研究項目14項)，省自然科學基金資助項目79項，其中杰出青年基金項目2項；在國家級、省級學術期刊發表教研、科研論文2197篇，發表第一作者或通訊作者SCI收錄論文474篇，其中影響因子超過5以上的99篇，超過10以上的10篇；出版專著、教材、工具書600余部；獲國家級，省、部級，市級科研成果獎407項，其中教育部高等學校科學研究優秀成果二等獎2項，中華醫學科技獎（醫學科學技術獎）三等獎1項，黑龍江省政府科學技術一等獎1項、二等獎6項。黑龍江省慢性病基礎研究與健康管理重點實驗室、黑龍江省寒地疾病精準診療技術創新中心、黑龍江省醫學科學院生物制藥研究所、中國人民解放軍軍事醫學科學院環境醫學研究基地、黑龍江省高校工程技術研發平臺新藥技術研發平臺等都設在校區。大慶校區先后同美國、英國、澳大利亞、日本、俄羅斯等國家的近20所院校建立了友好校際關系，并廣泛開展學術交流與辦學合作，開展了多元化的合作交流，開放、融合的國際化辦學模式正逐步形成，實現了沖出黑龍江、全國領先的跨越式發展目標。