北京市藥品檢驗研究院（北京市疫苗檢驗中心）成立于1953年，原名北京市藥品檢驗所，是國家最早確認的口岸藥品檢驗機構之一，也是全國第一批省級生物制品批簽發檢驗機構。2021年8月經北京市編委批復同意，更名為北京市藥品檢驗研究院，并掛北京市疫苗檢驗中心牌子，主要承擔藥品（含疫苗）、化妝品、保健食品檢驗檢測和相關技術標準研究制定等職能。北京市藥品檢驗研究院位于昌平區中關村生命科學園。全院專業技術人員近300人，其中國家藥典委員、國家藥品、化妝品評審專家50余人。配備各類先進儀器設備2600余臺套，檢驗能力覆蓋藥品、生物制品、化妝品、保健食品、藥包材、潔凈環境、醫療器械等七個領域。擁有三個國家藥監局重點實驗室、一個北京市重點實驗室、一個博士后工作站、一個GLP藥物安全評價中心，同時也是國家藥監局藥品法治宣傳教育基地，國家藥監局食品藥品審核查驗中心檢查員實訓基地，北京市科普基地，以及全國藥學專業學位研究生培養示范基地。近十年來，北京市藥品檢驗研究院承擔國家科技部重大專項以及北京市科技項目等各類科研課題近400項，獲北京市科學技術獎3項，授權發明專利50余件。出色完成了北京奧運會、國慶60周年、紀念抗戰勝利70周年閱兵、建黨百年及2022年冬奧會、冬殘奧會等重大活動的藥品、化妝品安全保障任務。新冠疫情期間，北京市藥品檢驗研究院迅速組建疫苗檢驗室，率先取得國家藥監局新冠疫苗批簽發授權，按照國家藥監局部署，為保障國家疫苗質量安全和供應發揮了重要作用，受到北京市、國家藥監局的表揚。